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薏苡用种子繁殖，一般情况下黑穗病发生较重，所以，播种前要进行种子处理。首先通过种子清选将病粒、秕粒、青粒去掉后，再把饱满无病种子进行以下处理。
药剂浸种：种子装入布袋，用5%石灰乳或1:1:120倍波尔多液浸种24~48小时，用清水冲洗2遍后播种。药物拌种：用苯醚甲环唑种衣剂进行拌种。开水烫种：将种子装入筐内，先用冷水浸泡12小时，再转入沸水中烫8~10秒，立即取出摊晾散热，晾干种子表面水分后播种。
薏苡适应性强，水田和旱田均可种植，但以向阳肥沃的壤土或黏壤土有利于薏苡生长，可选向阳有流水的渠边、河边、溪边、田边等零星地段或山岙平地和山冈坡地种植，也可选排灌方便，潮湿的水稻田种植。前作收获后及时进行耕翻；耕深20~25cm，结合整地亩施腐熟的有机肥2000~2500kg，氮、磷、钾复合肥50kg，整平耙细，做1.5~2m宽的平畦，畦长依地势而定，整好地后待播。
薏苡种子繁殖以直播为主，可分为春播和夏播，春播在4月中下旬，以土壤深5cm处地温稳定在15℃以上为宜；夏播在油菜或大、小麦收获后播种，因生育期短，植株矮小，适当增加密度。
直播：一般采用条播或穴播，以穴播通风透光、不宜倒伏为好。穴播方法：按行距 50cm，穴(株)距40~45cm，每穴 6~10 粒，覆土 3cm 左右；气温在 20℃左右时，15 天出苗，出苗前不浇水。穴播每亩用种子 5kg。目前大面积种植可以用播种机进行机械化播种。
(1)中耕除草及间苗定苗
出苗后多松土，勤中耕除草少浇水，以利蹲苗；如太旱可适当浇水；薏苡封行前进行2~3次中耕除草。第3次结合中耕除草进行培土防倒伏。苗高 7~10cm 或长有 3~4 片真叶时进行间苗，去弱留强，去小留大，去密留匀；每穴留苗 4~6 株，遇缺苗及时补栽。
(2)追肥和灌排水
一般一年生薏苡追肥1次。追肥以三元复合肥或复混肥为宜，亩用量40~50kg，在薏苡封行前开沟施入，追后及时浇水。花期注意浇水，保持土壤湿润，否则瘪粒多，产量低。遇积水注意及时排水。
(3)人工辅助授粉
薏苡是雌雄同株异穗风媒花植物，同一花序中雄小花先成熟，往往需要异株花粉授精。花期如雌花授粉不良，易形成白粒或空壳。辅助授粉是提高薏苡结实率并增产的主要措施。选在薏苡开花盛期的晴天上午10~12时进行。两人相隔数垄，横拉绳，顺垄沟同向走动，使其茎秆振荡，花粉飞扬。在花期每隔3~5天可进行1次人工辅助授粉，进行多次。
薏苡主要病害有黑穗病、叶枯病等，此类病害在蔬菜、瓜果、茶叶等绿色生产、控害减灾方面多采用如下措施：
(1)黑穗病
①病原及症状：属担子菌亚门、薏苡黑粉菌。主要危害穗部，也可侵害叶片及叶鞘。病株苗期不表现症状，10片叶以后在上部嫩叶和叶鞘上出现单个或成串的紫红色瘤状突起，严重时叶片扭曲，瘤状突起干瘪后呈褐色，内有黑粉；穗部受害时，子房膨大，最初紫红色，后变为暗褐色，比正常果实大，子房壁不易破裂，内部充满黑粉。病株主茎及分蘖茎的每个生长点都变成一个黑粉病疱，籽粒变成菌瘿。
病菌附着在种子上或土壤里越冬。翌春土温升到 10~18℃时，土壤湿度适当即可侵入薏苡的幼芽，后随植株生长上升到穗部，致组织遭到破坏而变成黑穗，当黑穗上的小黑疱裂开时，又散出黑褐色粉末，借风雨传播到健康种子上或落入土中，引起下年发病。连年种植或不进行深翻的田块易发病。
②防治方法
★农业防治：建立无病留种田并经常检查，发现病株立即拔除烧掉；施用充分腐熟的有机肥，配方和平衡施肥，合理补微肥，配合推广使用生物菌肥、生物有机肥，增强抗病抗逆能力；对重病地块实行3年以上轮作，不与禾本科轮作；选种时先株选后粒选，剔除黑穗病侵染的种子。
★科学用药防治：播前药剂拌种处理，可用3.5%满适金(1%精甲霜灵+2.5%咯菌腈)种衣剂(药种比1:1000)，或30%苯醚甲环唑悬浮种衣剂拌种。与植物诱抗剂海岛素(5%氨基寡糖素)水剂800倍液混用拌种更佳。
(2)叶枯病
①病原及症状：属半知菌亚门、薏苡平脐蠕孢菌。主要危害叶片和叶鞘，出现黄色小斑，病斑椭圆形、梭形或长条形，浅褐色，边缘颜色较深，后期病部生黑色霉层。
通常下部老叶先发病，逐步向上部叶片蔓延。叶片病斑多时可相互汇合导致叶片枯死。雨季发生严重。
②防治方法
★农业防治：薏苡收获后将病残株集中烧掉；与非禾本科作物轮作；选择抗病的矮秆品种，并统一播种期；合理密植，注意通风透光；加强田间管理，配方和平衡施肥，增施腐熟的有机肥，合理补微肥；配合推广使用生物菌肥、生物有机肥，增强抗病抗逆能力。
★科学用药防治：发病初期及时防治，可用42%寡糖·硫黄悬浮剂600倍液，或植物诱抗剂海岛素(5%氨基寡糖素)水剂1000倍液+10%苯醚甲环唑水乳剂1000倍液(或80%全络合态代森锰锌可湿性粉剂1000倍液、75%肟菌·戊唑醇水分散剂2000倍液、25%嘧菌酯悬浮剂1500倍液等)喷雾防治。每7~10天喷1次，连续喷施2~3 次。
薏苡主要害虫有玉米螟、黏虫等，此类害虫在蔬菜、瓜果、茶叶等绿色生产、控害减灾方面多采用如下措施。
(1)玉米螟
属鳞翅目、螟蛾科。
①为害状：1~2龄幼虫钻入幼苗心叶中咬食叶肉或中脉，常见1排整齐的小孔洞。2~3龄幼虫钻入茎内危害，往往被蛀成空心而倒折，即使不折断也形成白穗。
老熟幼虫在薏苡或玉米秆内越冬。1年发生2~4代，世代重叠。以8~9月的第3代危害薏苡仁最重。部分幼虫在薏苡秆内化蛹。产卵在叶背中脉附近。
②防治方法
★农业防治：在早春玉米螟羽化前，把玉米秆和薏苡秆集中沤肥处理，以消灭越冬虫源；加强植株心叶部位的虫情检查，及时拔除钻心苗子集中销毁。
★物理防治：规模化利用杀虫灯诱杀成虫于产卵之前。
★生物防治：应用性诱剂诱杀雄虫于交配之前。心叶展开时和抽穗前后喷每1g含100亿孢子 Bt 生物制剂300~500倍液，或0.36%苦参碱水剂800倍液，或2.5%多杀霉素悬浮剂1500倍液等喷雾防治。
★科学用药防治：幼虫未钻蛀前及时喷药，可用5%虱螨脲乳油2000倍液，或10%溴氰虫酰胺可分散油悬浮剂 2000倍液，或20%氯虫苯甲酰胺悬浮剂1000倍液或16%甲维盐·茚虫威(4%甲氨基阿维菌素苯甲酸盐+12%茚虫威)悬浮剂3000倍液等喷雾防治。
(2)黏虫
属鳞翅目、夜蛾科
①为害状：黏虫属于迁飞性暴发性害虫，幼虫具有群居集中危害的特点，暴发时可在短期内把作物叶片食光，往往对作物危害极大。我国从北到南一年可发生2~8代。河北省1年发3代，以危害玉米最重。迁入薏苡种植区域往往受害。
②防治方法
★生物防治：雄虫交配之前规模化应用性诱剂诱杀。在低龄幼虫期未扩散前，可及时选用昆虫生长调节剂进行防治，降低污染，保护天敌。
★科学用药防治：低龄幼虫期及时防治，优先选用5%氟虫脲乳油50~75ml，或20%除虫脲悬浮剂10ml，或 25%灭幼脲悬浮剂30~40ml喷雾防治，可最大限度地保护天敌资源和传媒昆虫。其他药剂可用50%辛硫磷乳油 1000倍液，或2.5%溴氰菊酯乳油2500倍液，或20%氯虫苯甲酰胺悬浮剂1000倍液等喷雾防治。
9月底~10月，当茎叶变枯黄，80%果实呈浅褐色或黄色时，选择晴天割下带果穗的茎秆，收割的茎秆集中立放 3~4 天后再脱粒，使未完全成熟的种子继续灌浆。
采用打谷机脱粒，用孔径比薏苡大的筛网和风车除去碎叶和杂质，并扬去空壳、瘪粒。选择晴朗天气，在干净的晒场上摊晒薏苡。摊晒时将薏苡耙成波浪形，厚度不超过5cm，1~2小时翻动1次，用风车扇去碎壳屑、瘪壳等杂质。用脱壳机碾去外壳。得白色光亮的薏苡仁，用风车扇去壳皮、黄色种皮、粉尘及碎屑。
